Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms