Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Wdr61Q9ERF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms