Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn2Q9ER65 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn2Q9ER65 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms