Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nif3l1Q9EQ80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nif3l1Q9EQ80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms