Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r47Q9EQ51 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms