Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SyncQ9EPM5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms