Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms