Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GabarapQ9DCD6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabarapQ9DCD6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms