Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf1Q9DBU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms