Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms