Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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