Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700025F22RikQ9D9Y7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms