Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc1Q9D9T8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms