Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms