Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2310002L09RikQ9D7L5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms