Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs8Q9D6Y4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms