Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms