Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmntd1Q9D4C1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms