Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tssk4Q9D411 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk4Q9D411 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms