Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms