Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms