Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
5430402E10RikQ9D3N5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms