Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms