Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eef1e1Q9D1M4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eef1e1Q9D1M4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eef1e1Q9D1M4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eef1e1Q9D1M4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms