Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms