Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed5Q9CXE7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms