Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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