Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sugt1Q9CX34 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sugt1Q9CX34 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms