Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud1Q9CUB6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms