Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms