Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933400A11RikQ9CR52 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933400A11RikQ9CR52 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms