Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd1Q9CR42 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms