Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr3kQ9CQZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms