Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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