Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NenfQ9CQ45 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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NenfQ9CQ45 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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NenfQ9CQ45 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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NenfQ9CQ45 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NenfQ9CQ45 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms