Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
StambpQ9CQ26 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms