Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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