Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms