Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sike1Q9CPR7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms