Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB2BQ9BVA1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms