Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms