Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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