Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrabdQ99JY4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrabdQ99JY4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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