Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms