Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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