Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Alpk3Q924C5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Alpk3Q924C5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Alpk3Q924C5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Alpk3Q924C5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alpk3Q924C5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alpk3Q924C5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms