Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim59Q922Y2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim59Q922Y2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms