Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pde6cQ91ZQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Pde6cQ91ZQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Pde6cQ91ZQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Pde6cQ91ZQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Pde6cQ91ZQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde6cQ91ZQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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