Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubtd1Q91WB7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubtd1Q91WB7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms