Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox4i2Q91W29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms